11月5至6日，2009年全国地方基础研究工作研讨会在厦门隆重召开。科技部曹健林副部长、福建省和厦门市相关领导出席会议。科技部基础研究司、国家自然科学基金委员会、全国37个省、自治区、直辖市和计划单列市的科技厅（委、局）的150余名代表参加了会议。
本次研讨会围绕“加强地方基础研究，推动创新型国家建设”的主题，回顾近年来我国基础研究的发展，总结了近三年973计划前期专项和省部共建实验室建设的工作，分析了“十二五”我国优先发展科学领域的重大战略问题。与会代表分组讨论、交流各地基础研究工作的经验，探讨地方基础研究的工作思路，并提出了对973计划前期专项和省部共建实验室的需求建议。
曹健林副部长讲话中强调，我国科技工作经过60年的发展，在科学技术体系、高素质科技人才队伍、科学研究水平等方面不断实现了新的跨越；基础研究工作卓有成效，有力的促进了经济社会发展，研究实力显著提升，大大缩短了与国际先进水平的差距；地方基础研究的投入不断加大，工作机制不断创新，成绩斐然。曹健林副部长针对基础研究在投入、培养“领军人才”、改善科研环境等三个方面主要存在的问题进行了详细剖析，提出指导性意见。一要高度重视基础研究的战略意义和重大作用；二要多方面增加基础研究的投入；三要不断创新机制，加强区域创新能力建设；四要突出地方特色，充分发挥基础研究引领作用。并要求各省市结合新的形势，抓住机遇，积极应对金融危机的挑战，大力发展基础研究，围绕区域经济结构调整、新兴产业发展的新需求，制定有利于区域创新发展的政策和措施，切实发挥基础研究的引领和推动作用。